Izolovanje, aktivnost i bioinformatička analiza ficina 1c
Authorized Users Only
2020
Master Thesis (Published version)
,
Univerzitet u Beogradu - Hemijski fakultet
Metadata
Show full item recordAbstract
U okviru ovog završnog rada predstavljeno je izolovanje i karakterizacija bazne
izoforme ficina, proteaze pronaĎene u lateksu koji je sakupljen krajem juna iz ploda drveta smokve (Ficus carica) koja raste u Baru, u Crnoj Gori. Izolovanje je izvedeno primenom jonoizmenjivačke hromatografije, a čistoća dobijene frakcije je proverena reverzno-faznom hromatografijom i SDS-PAGE elektroforezom. U saradnji sa profesorom J. Lahom1 tripsinskim mapiranjem je na osnovu transkriptomske sekvence utvrđeno da je izolovana izofoma ficin 1c. Primenom infracrvene spektroskopije sa Furijeovom transformacijom (FTIR) određen je sadržaj sekundarnih struktura u ovoj izoformi. Modelovanje 3D strukture ficina 1c izvedeno je primenom Phyre2 servera, a slaganje sekvenci sa ostalim izoformama ficina izvedeno je uz pomoć MAFFT programa.
Na osnovu dobijenih rezultata modelovanja 3D strukture i sličnosti sekundarnih
struktura, zaključeno je da je obrazac uvijanja ficina 1c gotovo identičan uvijanju drugih izoform...i ficina izolovanih iz različitih sorti smokve, kao i drugih biljnih cistein proteaza, kao što je papain. U prilog ovom zaključku govore i rezultati upoređivanja sekvenci, koji pokazuju evolutivnu konzerviranost cisteinskih ostataka, koji zbog katalitičke aktivnosti i izgradnje disulfidnih mostova imaju presudan uticaj na trodimenzionalnu strukturu proteina.
Keywords:
ficin 1c / izolovanje / karakterizacija / aktivnost / strukturaSource:
2020, 1-36Collections
Institution/Community
Hemijski fakultet / Faculty of ChemistryTY - THES AU - Đurković, Filip T. PY - 2020 UR - https://cherry.chem.bg.ac.rs/handle/123456789/4114 AB - U okviru ovog završnog rada predstavljeno je izolovanje i karakterizacija bazne izoforme ficina, proteaze pronaĎene u lateksu koji je sakupljen krajem juna iz ploda drveta smokve (Ficus carica) koja raste u Baru, u Crnoj Gori. Izolovanje je izvedeno primenom jonoizmenjivačke hromatografije, a čistoća dobijene frakcije je proverena reverzno-faznom hromatografijom i SDS-PAGE elektroforezom. U saradnji sa profesorom J. Lahom1 tripsinskim mapiranjem je na osnovu transkriptomske sekvence utvrđeno da je izolovana izofoma ficin 1c. Primenom infracrvene spektroskopije sa Furijeovom transformacijom (FTIR) određen je sadržaj sekundarnih struktura u ovoj izoformi. Modelovanje 3D strukture ficina 1c izvedeno je primenom Phyre2 servera, a slaganje sekvenci sa ostalim izoformama ficina izvedeno je uz pomoć MAFFT programa. Na osnovu dobijenih rezultata modelovanja 3D strukture i sličnosti sekundarnih struktura, zaključeno je da je obrazac uvijanja ficina 1c gotovo identičan uvijanju drugih izoformi ficina izolovanih iz različitih sorti smokve, kao i drugih biljnih cistein proteaza, kao što je papain. U prilog ovom zaključku govore i rezultati upoređivanja sekvenci, koji pokazuju evolutivnu konzerviranost cisteinskih ostataka, koji zbog katalitičke aktivnosti i izgradnje disulfidnih mostova imaju presudan uticaj na trodimenzionalnu strukturu proteina. T1 - Izolovanje, aktivnost i bioinformatička analiza ficina 1c SP - 1 EP - 36 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4114 ER -
@mastersthesis{ author = "Đurković, Filip T.", year = "2020", abstract = "U okviru ovog završnog rada predstavljeno je izolovanje i karakterizacija bazne izoforme ficina, proteaze pronaĎene u lateksu koji je sakupljen krajem juna iz ploda drveta smokve (Ficus carica) koja raste u Baru, u Crnoj Gori. Izolovanje je izvedeno primenom jonoizmenjivačke hromatografije, a čistoća dobijene frakcije je proverena reverzno-faznom hromatografijom i SDS-PAGE elektroforezom. U saradnji sa profesorom J. Lahom1 tripsinskim mapiranjem je na osnovu transkriptomske sekvence utvrđeno da je izolovana izofoma ficin 1c. Primenom infracrvene spektroskopije sa Furijeovom transformacijom (FTIR) određen je sadržaj sekundarnih struktura u ovoj izoformi. Modelovanje 3D strukture ficina 1c izvedeno je primenom Phyre2 servera, a slaganje sekvenci sa ostalim izoformama ficina izvedeno je uz pomoć MAFFT programa. Na osnovu dobijenih rezultata modelovanja 3D strukture i sličnosti sekundarnih struktura, zaključeno je da je obrazac uvijanja ficina 1c gotovo identičan uvijanju drugih izoformi ficina izolovanih iz različitih sorti smokve, kao i drugih biljnih cistein proteaza, kao što je papain. U prilog ovom zaključku govore i rezultati upoređivanja sekvenci, koji pokazuju evolutivnu konzerviranost cisteinskih ostataka, koji zbog katalitičke aktivnosti i izgradnje disulfidnih mostova imaju presudan uticaj na trodimenzionalnu strukturu proteina.", title = "Izolovanje, aktivnost i bioinformatička analiza ficina 1c", pages = "1-36", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4114" }
Đurković, F. T.. (2020). Izolovanje, aktivnost i bioinformatička analiza ficina 1c. , 1-36. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4114
Đurković FT. Izolovanje, aktivnost i bioinformatička analiza ficina 1c. 2020;:1-36. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4114 .
Đurković, Filip T., "Izolovanje, aktivnost i bioinformatička analiza ficina 1c" (2020):1-36, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_cherry_4114 .