Show simple item record

Statistička zavisnost sekundarne strukture proteina od frekvencije digrama aminokiselina

dc.creatorŽivković, Miodrag
dc.creatorMalkov, Saša
dc.creatorZarić, Snežana D.
dc.creatorVujošević-Janičić, Milena
dc.creatorTomašević, Jelena
dc.creatorPredović, Goran
dc.creatorBlažić, Novica
dc.creatorBeljanski, Miloš V.
dc.date.accessioned2018-11-22T00:09:15Z
dc.date.available2018-11-22T00:09:15Z
dc.date.issued2006
dc.identifier.issn1451-9372
dc.identifier.urihttps://cherry.chem.bg.ac.rs/handle/123456789/215
dc.description.abstractThe statistical dependence of protein secondary structure on amino acid bigram frequencies was studied. Proteins in the PDBSELECT subset of the Protein Data Bank database were investigated. Protein secondary structures were determined using DSSP software. The conditional probabilities of protein secondary structures were calculated and presented. The results on bigrams show the frequencies of all the possible bigrams in all secondary structure types. These results elucidate some factors important for the prediction of the secondary structures of proteins based on the amino acid sequence. © 2017, CI and CEQ. All rights reserved.en
dc.description.abstractU radu je opisana statistička zavisnost sekundarne strukture proteina od bigrama aminokiselina. Istraživanje je urađeno na proteinima koji se nalaze u podskupu PDBSELECT baze podataka o proteinima Protein Data Bank (PDB). Sekundarne strukture proteina su određene primenom programa DSSP. Izračunate su i prikazane uslovne verovatnoće pojavljivanja različitih sekundarnih struktura. Rezultati za bigrame su prikazani za sve tipove sekundarnih struktura. Rezultati ukazuju na faktore koji su značajni za predviđanje sekundarne strukture proteina koje je zasnovano na redosledu aminokiselina u proteinu.sr
dc.rightsopenAccess
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.sourceChemical Industry and Chemical Engineering Quarterly / CICEQ
dc.subjectAmino-acid pairsen
dc.subjectBigramen
dc.subjectprotein secondary structureen
dc.subjectBigram frequenciesen
dc.subjectbigramen
dc.subjectProtein secondary structureen
dc.subjectbigram frequenciesen
dc.subjectparovi aminokiselinasr
dc.subjectsekundarena struktura proteinasr
dc.subjectbigramsr
dc.subjectučestalost bigramasr
dc.titleStatistical dependence of protein secondary structure on amino acid bigrams [Statistička zavisnost sekundarne strukture proteina od frekvencije bigrama aminokiselina]en
dc.titleStatistička zavisnost sekundarne strukture proteina od frekvencije digrama aminokiselinasr
dc.typearticle
dc.rights.licenseBY-NC-ND
dcterms.abstractЖивковић, Миодраг; Зарић, Снежана; Блажић, Новица; Предовић, Горан; Томашевић, Јелена; Вујошевић-Јаничић, Милена; Малков, Саша; Бељански, Милош В.; Статистичка зависност секундарне структуре протеина од фреквенције диграма аминокиселина; Статистичка зависност секундарне структуре протеина од фреквенције диграма аминокиселина;
dc.citation.volume12
dc.citation.issue1
dc.citation.spage82
dc.citation.epage85
dc.identifier.doi10.2298/CICEQ0601082Z
dc.citation.other12(1): 82-85
dc.type.versionpublishedVersion
dc.identifier.scopus2-s2.0-85034436993
dc.identifier.fulltexthttps://cherry.chem.bg.ac.rs/bitstream/id/9154/213.pdf
dc.identifier.rcubKon_149


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record