Poređenje i procena osetljivosti tri različita komercijalna real-time PCR kita za detekciju SARS-⁠CoV-⁠2

Abstract

Lančana reakcija polimerazacije sa reverznom transkripcijom u realnom vremenu (RT-qPCR) je najsenzitivniji i najspecifičniji test za laboratorijsku dijagnostiku SARS-CoV-2 infekcije i predstavlja “zlatni standard”. Cilj ovog rada je poređenje i analiza performansi tri različita komercijalna kita za detekciju SARS-CoV-2 virusa (Sansure Biotech, GeneFinderTM i TaqPathTM) metodom RT-qPCR na 354 nasumično izabrana uzorka hospitalizovanih pacijenata sa COVID-19. Ekstrakcija RNK iz uzoraka je urađena na automatskom ekstraktoru NC-15 plus (ALPHAGENE Co., Ltd.) prema uputstvu proizvođača. Sve PCR reakcije su izvedene korišćenjem istih RNK izolata na jednom PCR aparatu (Applied Biosystems). Rezultati pokazuju veliku sličnost u analitičkoj osetljivosti testova za detekciju SARS-CoV-2 virusa, što ukazuje da je dijagnostička tačnost ova tri testa uporediva. Međutim, SanSure Biotech kit pokazao je bolje dijagnostičke performanse u odnosu na druga dva testa. Naši rezultati takođe upućuju i da je u ciju poboljšanja osetljivosti testova neophodno modifikovati prajmere za PCR reakciju zajedno sa pojavom novih varijanti virusa.