Teorijsko proučavanje interakcija glikozilovanih flavonoida sa lipokalinima

Abstract

Beta laktoglobulin (BLG) je glavni protein surutke i veoma poznat alergen koji poseduje više mesta za vezivanje liganda. BLG pokazuje afinitet prema širokom spektru bioaktivnih jedinjenja, kao što su masne kiseline, vitamini i polifenolna jedinjenja. Bet v 1 je protein koji je u velikoj meri prisutan u polenu stabla bele breze i primarni je uzrok alergije na polen breze kod ljudi. Bet v 1 vezuje niz fiziološki relevantnih liganda uključujući masne kiseline, flavonoide i citokinine. Biološka funkcija Bet v 1 nije poznata. Međutim, pretpostavlja se da neobična karakteristika tercijarne strukture Bet v 1, unutrašnja šupljina, igra centralnu ulogu u biološkoj funkciji molekula, i verovatno to čini kroz specifičnu interakciju sa nepoznatim ligandom. Flavonoidi su jedna od grupa bioaktivnih jedinjenja koja su opsežno proučavana. Bioaktivna jedinjenja imaju veliki potencijal da budu korišćena u „ojačavanju“ hrane zarad zdravstvenih koristi. U ovom radu su teorijskim metodama proučavane interakcije i efekti vezivanja glikozilovanih polifenola, (izoramnetin-3-O-glukozid, izoramnetin 3-O-(malonil 3-O- glukozid), kvercetin 3-O (malonil 3-O-glukozid) i izoramnetin-3-O-rutinozid)), sa Bet v1 i BLG u obliku monomera i dimera. Metodom slepog dokinga su pronađena mesta vezivanja flavonoida za ispitivane proteine i analizirane interakcije koje ovi flavonoidi grade sa aminokiselinskim ostacima u okruženju. Pokazano je da na vezivanje glikozilovanih flavonoida za lipokaline najviše utiče šećerna komponenta koja, sa jedne strane, može uticati na povećan afinitet vezivanja usled većeg broja hidroksilnih grupa koje poseduje, a sa druge strane, može smanjiti ili čak onemogućiti pristup unutrašnjoj šupljini proteina, usled velike zapremine.